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《中華醫學百科全書》的編纂力求做到兩個符合。一是符合社會發展趨勢：全面貫徹以人為本的科學發展觀指導思想，通過普及醫學知識，增強人民群眾健康意識，提高人民群眾健康水平，促進社會主義和諧社會構建。二是符合醫學發展趨勢：遵循先進的國際醫學理念，以“戰略前移、重心下移、模式轉變、系統整合”的人口與健康科技發展戰略為指導。同時，《中華醫學百科全書》的編纂力求做到兩個體現：一是體現科學思維模式的深刻變革，即學科交叉滲透／知識系統整合；二是體現繼承發展與時俱進的精神，準確把握學科現有基礎理論、基本知識、基本技能以及經典理論知識與科學思維精髓，深刻領悟學科當前面臨的交叉滲透與整合轉化，敏銳洞察學科未來的發展趨勢與突破方向。 作為未來著作的“基準點”和“金標準”，《中華醫學百科全書》編纂過程中，制定了嚴格的主編、編者遴選原則，聘請了一批在學界有相當威望、具有較高學術造詣和較強組織協調能力的專家教授（包括多位兩院院士）擔任大類主編和學科卷主編，確保全書的科學性。另外，還借鑒了已有百科全書的編寫經驗。鑒於《中華醫學百科全書》的編纂過程本身帶有科學研究性質，還聘請了若干科研院所的科研管理專家作為特約編審，站在科研管理的高度為全書的順利編纂保駕護航。除了編者、編審隊伍外，還制訂了詳盡的質量保證計劃。編纂委員會和工作委員會秉持質量源於設計的理念，共同制訂了一系列配套的質量控制規範性文件，建立了一套切實可行、行之有效、效率優的編纂質量管理方案和各種情況下的處理原則及預案。