細菌真菌耐藥監測實用手冊（簡體書）

本書系統介紹常見細菌真菌耐藥監測工作實務內容，是對復旦大學附屬華山醫院抗生素研究所等團隊從1988年至今30餘年間細菌真菌耐藥監測工作的總結，包括總論、細菌（革蘭陽性、革蘭陰性兩種）真菌和抗菌藥、藥敏試驗方法學、耐藥表型和分子生物學檢測、細菌耐藥監測數據規範化、其他細菌和抗菌藥等八個部分。附錄部分特別邀請一線臨床專家，通過10個病例，介紹如何運用藥敏試驗結果和耐藥監測大數據指導科學用藥和實施治療。權威實用，指導性強，方便初始者或已經開展細菌和真菌耐藥性監測工作的同道借鑒和使用，並可促進臨床醫生學習瞭解臨床微生物學、藥敏試驗和細菌真菌耐藥監測知識，合理選用抗菌藥物。

朱德妹， 復旦大學附屬華山醫院抗生素研究所研究員，博士生導師。《中國感染與化療雜誌》第1、2、3屆的常務編委、現任常務副主編；《中華傳染病雜誌》第三、四屆常務編委、《中華醫學雜誌》第27屆和《檢驗醫學雜誌》第三、四、五屆編委。主編、參編學術專著8部。近5年來發表論文25篇。主要的科研成果曾獲得國家教委2001年自然科學進步獎二等獎、上海市2001年科技進步三等獎等10余項。
吳文娟，同濟大學附屬東方醫院南院醫學檢驗科主任，主任技師，博士研究生導師。上海交通大學醫學院病原生物學博士、美國范登堡大學醫學院、美國梅奧醫學中心訪問學者。 中國女醫師協會檢驗醫學分會副主任委員、中華醫學會結核病學分會基礎委員會委員、中華醫學會微生物學與免疫學分會臨床微生物學組委員、中國老年醫學學會檢驗醫學分會委員、中國中西醫結合學會檢驗醫學專業委員會感染性疾病檢驗診斷學術委員會副主任委員、上海市微生物學會理事兼臨床微生物學專委會候任主任委員、上海市醫學會分子診斷分會委員兼感染病學組組長、中國合格評定國家認可委員會主任評審員等。 研究方向為感染性疾病實驗診斷、病原微生物分子檢測及耐藥機制、醫院感染控制等。負責主持國家科技重大專項課題1項、國家自然科學基金2項、省市級縱向課題6項、入選上海市衛生系統優秀學科帶頭人、浦東新區學科帶頭人，副主編、參編專著10部，發表SCI和核心期刊論文70餘篇，申請專利8項。
胡付品， 醫學博士，副研究員，碩士生導師。復旦大學附屬華山醫院抗生素研究所臨床微生物室主任，衛生部抗生素臨床藥理重點實驗室副主任，美國匹茲堡大學醫學院訪問學者，歐洲ESCMID細菌耐藥監測組委員，全國細菌耐藥監測學術委員會委員、實踐培訓基地負責人、數據分析小組副組長。
兼任中國老年醫學學會檢驗醫學分會常委、上海市微生物學會微生物耐藥防控專委會(籌)侯任主委、“上海市細菌和真菌耐藥性監測網”負責人、“CHINET中國細菌耐藥監測網”數據處理和統計分析負責人。主要從事細菌耐藥性監測、耐藥機制和醫院感染控制研究，以第一作者或通訊作者發表論文30篇，其中SCI論文18篇。主持國家自然科學基金和上海市自然科學基金等課題，主編著作多部。

汪複、倪語星、俞雲松、張秀珍教授聯袂作序推薦國內30餘年細菌真菌耐藥監測工作總結8章35節再加10個臨床典型病案臨床微生物實驗室必備工具書感染科醫師提升診療能力必讀

汪複、倪語星、俞雲松、張秀珍教授聯袂作序推薦國內30餘年細菌真菌耐藥監測工作總結8章35節再加10個臨床典型病案臨床微生物實驗室必備工具書感染科醫師提升診療能力必讀

第一章總論1

第一節細菌真菌耐藥監測的目標和方法1

一、監測菌種的要求2

二、藥物敏感性試驗3

三、統計學軟件3

四、藥敏數據的收集4

第二節細菌真菌耐藥監測材料4

一、藥敏培養基4

二、藥敏紙片4

三、機器法藥敏板卡4

第三節藥敏試驗結果判讀標準5

一、藥敏試驗結果判讀的折點標準5

二、抗菌藥物和細菌組合6

三、CLSI藥敏試驗結果判讀折點標準6

四、CLSI M100折點使用注意事項7

第四節質量保證體系8

一、建立專家系統9

二、建立中心實驗室9

三、建立督查考核制度9

第二章革蘭陽性細菌和抗菌藥11

第一節葡萄球菌屬細菌11

一、流行病學11

二、耐藥機制12

三、葡萄球菌屬和抗菌藥組合12

第二節腸球菌屬細菌14

一、流行病學14

二、耐藥機制15

三、腸球菌屬和抗菌藥組合16

第三節肺炎鏈球菌和其他鏈球菌屬細菌18

一、流行病學18

二、耐藥機制18

三、鏈球菌屬和抗菌藥組合19

第三章革蘭陰性細菌和抗菌藥23

第一節腸桿菌目細菌23

一、流行病學23

二、耐藥機制24

三、腸桿菌目細菌和抗菌藥組合25

四、藥敏報告注意事項27

第二節銅綠假單胞菌28

一、流行病學28

二、耐藥機制29

三、銅綠假單胞菌和抗菌藥組合30

第三節不動桿菌屬細菌33

一、流行病學33

二、耐藥機制34

三、不動桿菌屬和抗菌藥組合34

第四節嗜麥芽窄食單胞菌36

一、流行病學36

二、耐藥機制37

三、嗜麥芽窄食單胞菌和抗菌藥組合37

第五節洋蔥伯克霍爾德菌38

一、流行病學38

二、耐藥機制39

三、洋蔥伯克霍爾德菌和抗菌藥組合39

第六節嗜血桿菌屬細菌40

一、流行病學40

二、耐藥機制41

三、流感嗜血桿菌和抗菌藥組合42

第七節卡他莫拉菌43

一、流行病學43

二、耐藥機制44

三、卡他莫拉菌和抗菌藥組合44

第八節其他非腸桿菌目細菌45

一、流行病學和耐藥機制45

二、其他非腸桿菌目細菌和抗菌藥組合46

第四章真菌和抗真菌藥47

第一節念珠菌屬47

一、流行病學47

二、耐藥機制47

三、抗真菌藥品種和藥敏試驗要求49

第二節絲狀真菌53

一、流行病學53

二、耐藥機制53

三、抗菌藥品種和藥敏試驗要求55

四、藥敏試驗推薦原則56

第五章藥敏試驗方法學59

第一節紙片擴散法59

一、定義59

二、原理59

三、適用範圍59

四、操作步驟59

第二節E試驗66

一、定義66

二、原理66

三、適用範圍66

四、操作步驟66

五、E試驗結果的讀取67

六、質控67

七、在E試驗過程中的注意事項68

第三節肉湯微量稀釋法68

一、定義68

二、原理69

三、適用範圍69

四、操作步驟69

五、質控72

六、自動化肉湯法藥敏系統73

第四節瓊脂稀釋法73

一、定義及原理73

二、操作步驟74

第五節酵母菌藥敏試驗76

一、紙片擴散法76

二、肉湯微量稀釋法80

第六節絲狀真菌藥敏試驗87

一、紙片擴散法和E試驗87

二、肉湯微量稀釋法89

第六章耐藥表型和分子生物學檢測101

第一節革蘭陽性菌耐藥表型檢測101

一、青黴素酶101

二、甲氧西林耐藥葡萄球菌的檢測101

三、萬古黴素中介和耐藥金黃色葡萄球菌的檢測102

四、高水平氨基糖苷類耐藥及萬古黴素耐藥腸球菌檢測103

五、誘導克林黴素耐藥檢測103

六、青黴素耐藥肺炎鏈球菌104

第二節革蘭陰性菌耐藥表型檢測――β內醯胺酶105

一、超廣譜β內醯胺酶105

二、AmpC酶檢測107

三、碳青黴烯酶的檢測108

第三節革蘭陽性菌耐藥基因分子生物學檢測113

一、甲氧西林耐藥葡萄球菌(MRS)耐藥基因的檢測113

二、萬古黴素耐藥腸球菌耐藥基因的檢測114

第四節革蘭陰性菌耐藥基因分子生物學檢測116

一、超廣譜β內醯胺酶基因的檢測116

二、質粒介導AmpC酶基因的檢測118

三、碳青黴烯酶基因的檢測119

四、質粒介導喹諾酮類耐藥基因的檢測122

五、質粒介導氨基糖苷類耐藥基因檢測123

第五節真菌耐藥基因分子生物學檢測124

一、檢測原理125

二、檢測步驟125第七章細菌耐藥監測數據規範化128

第一節細菌耐藥監測數據審核和預處理128

一、臨床分離株信息準確性審核128

二、實驗室藥敏結果轉錄至WHONET軟件的有效性審核131

三、WHONET數據轉錄後的加工處理132

第二節細菌耐藥監測數據分析136

一、從耐藥監測數據文件快速建立實驗室配置文件136

二、“革蘭陰性菌”總數和“革蘭陽性菌”總數兩者相加後的數據與“所有細菌”的統計結果不符的原因和解決方案137

三、有些藥物在耐藥、中介和敏感區域均無數值，只在“%？”那一欄現出100，其原因和解決方案138

四、為何在MIC結果一欄出現紙片擴散法的結果？會對統計結果有何影響139

五、出現“所有標本”中統計的菌株數與所有的細菌數統計結果不一致時的解決方案140

六、多台電腦上WHONET軟件的輸入格式需要重新設置一致嗎140

七、出現“Type mismatch(類型不匹配)”的原因和解決方案141

八、出現“Overflow(溢出)”的原因和解決方案142

九、出現“Couldnt update： currently locked”錯誤提示的原因和解決方案142

十、統計MIC50或MIC90時出現G+MIC值(如G256)的原因和解決方案143

十一、怎麼提取細菌耐藥性監測數據中的部分數據做成子文件進行統計分析144

十二、將WHONET DOS版數據庫文件轉換為WHONET 5版本格式數據文件的設置方法144

第三節如何進行耐藥監測總結145

一、統計耐藥監測數據必須要做的預處理工作146

二、WHONET軟件主要功能簡介146

三、宏(Macros)的設置與應用150

第八章其他細菌和抗菌藥154

第一節厭氧菌154

一、流行病學154

二、耐藥機制154

第二節結核分枝桿菌164

一、流行病學164

二、耐藥機制165

三、抗菌藥品種和藥敏試驗要求166

四、推薦原則167

五、藥敏試驗方法167

六、分子生物學方法174

第三節非結核分枝桿菌179

一、流行病學179

二、耐藥機制180

三、抗菌藥品種和藥敏試驗要求180

四、推薦原則181

五、藥敏試驗方法182

第四節少見菌和特殊病原菌189

一、乏養球菌屬和顆粒鏈菌屬(即營養缺陷鏈球菌或營養變異鏈球菌)189

二、明串珠菌屬和片球菌屬190

三、氣球菌屬191

四、孿生球菌屬192

五、乳球菌屬193

六、微球菌屬194

七、棒桿菌屬(包括白喉棒桿菌及其他棒桿菌)194

八、豬紅斑丹毒絲菌196

九、產單核細胞李斯特菌197

十、乳桿菌屬198

十一、需氧芽胞桿菌屬(不包括炭疽芽胞桿菌)及相關菌屬199

十二、HACEK細菌群(包括凝聚桿菌屬、心桿菌屬、侵蝕艾肯菌、金氏桿菌屬)200

十三、氣單胞菌屬201

十四、弧菌屬(包括霍亂弧菌)203

十五、空腸彎麴菌和大腸彎麴菌204

十六、幽門螺桿菌205

十七、巴斯德菌屬206

十八、潛在生物恐怖病原菌(炭疽芽孢桿菌、鼠疫耶爾森菌、鼻疽伯克霍爾德菌、類鼻疽伯克霍爾德菌、土拉弗朗西斯菌和布魯氏菌)207

十九、黏滑羅氏菌210

二十、奴卡菌及其他需氧放線菌210

附錄臨床病例分析213

一、複雜性上尿路感染213

二、複雜性尿路感染215

三、皮膚軟組織感染217

四、社區獲得性化膿性腦膜炎(一)219

五、社區獲得性化膿性腦膜炎(二)221

六、感染性心內膜炎(一)223

七、感染性心內膜炎(二)225

八、深靜脈導管相關感染227

九、社區獲得性肺炎229

十、社區獲得性肝膿腫231