中藥DNA條形碼分子鑑定（簡體書）

《中藥DNA條形碼：分子鑒定》分為總論和各論兩部分描述。
總論部分對中藥DNA條形碼分子鑒定的原理、目的和意義，中藥DNA條形碼分子鑒定技術流程，中藥DNA條形碼分子鑒定體系的建立進行了詳細的介紹，并列舉了具體的研究實例。
各論部分以單個藥材進行闡述。具體藥材項下的體例及內容說明如下：
藥材名及其拼音、原植（動）物藥材拉丁名、原植（動）物拉丁名，該部分內容主要參考《中華人民共和國藥典》（2010年版）、《中國植物志》和《FloraofChina》。

陳士林，成都中醫藥大學博士畢業，現任中國醫學科學院藥用植物研究所所長、世界衛生組織傳統醫學合作中心主任。曾擔任香港理工大學訪問教授，并在英國皇家植物園丘園接受專業培訓，也曾在哈佛醫學院Mclean Hospital做訪問學者。現兼任“瀕危藥材繁育”國家工程實驗室主任、教育部長江學者創新團隊負責人、中國藥學會中藥與天然藥物專業委員會主任委員、中國野生植物保護協會野生藥用植物保育委員會主席、國家藥典委員會委員、美國藥典傳統中藥咨詢組顧問、《Chinese Herbal Medicines》副主編、《藥學學報》副主編等。
主持編寫了《中國藥材產地生態適宜性區劃》、《中華人民共和國藥典中藥材及原植物彩色圖鑒》等6部書籍，還獲得國家科技進步獎二等獎2項；發表論文200余篇，其中SCI論文100余篇，包括Cladistics、PLOSONE、PNAS、Nat Prod Rep等國際著名期刊。

第一篇 總論
第一章 緒論
第一節 DNA條形碼概述
一、中藥基原鑒定的方法
二、DNA條形碼分子鑒定技術的方法及原理
三、DNA條形碼發展簡史
第二節 中藥DNA條形碼鑒定的目的及意義

第二章 中藥DNA條形碼鑒定技術流程
第一節 樣品收集及DNA提取
一、樣品采集
二、DNA提取
第二節 PCR擴增及DNA條形碼序列獲取
一、PCR原理
二、PCR反應成分及反應體系
三、PCR擴增程序
四、PCR產物檢測與純化
五、序列測定及質量評估
第三節 數據分析與鑒定方法
一、DNA條形碼序列分析方法
二、DNA條形碼物種鑒定方法

第三章 中藥DNA條形碼鑒定體系
第一節 植物類藥材DNA條形碼序列篩選
一、國際社會推薦的幾個重要的植物DNA條形碼候選序列
二、藥用植物DNA條形碼篩選
三、以ITS2+psbA-trnH為主體的藥用植物DNA條形碼鑒定體系
第二節 應用ITS2作為通用條形碼序列鑒定動植物
一、ITS2在分子系統進化和DNA條形碼研究中的應用
二、應用ITS2條形碼對動植物的鑒定
三、動植物鑒定通用條形碼序列——ITS2
第三節 中藥DNA條形碼鑒定數據庫系統
一、中藥DNA條形碼數據庫構建
二、中藥DNA條形碼鑒定數據庫系統簡介
三、中藥DNA條形碼鑒定數據庫系統的使用方法

第四章 DNA條形碼在中藥領域中的應用研究實例
一、ITS2序列對中藥基原植物與科內密切相關種的鑒定
二、ITS2或psbA-trnH對中藥基原植物屬內密切相關種的鑒定
三、ITS2或psbA-trnH對中藥基原植物及其混偽品的鑒定
四、《中國藥典》全草類藥材DNA條形碼鑒定
五、基于DNA條形碼ITS2序列的皮類藥材鑒定

第二篇 各論
1.一枝黃花
2.九里香
3.人參
4.八角茴香
5.三七
6.三棱
7.千里光
8.土木香
9.土貝母
10.大葉紫珠
11.大棗
12.大青葉
13.大黃
14.大薊
15.女貞子
16.小茴香
17.山豆根
18.山柰
19.山銀花
20.川木通
21.川貝母
22.川芎
23.干姜
24.廣棗
25.廣金錢草
26.廣藿香
27.馬齒莧
28.馬錢子
29.馬鞭草
30.丹參
31.五加皮
32.五味子
33.化橘紅
34.升麻
35.天山雪蓮
36.天冬
37.天南星
38.太子參
39.巴豆
40.木蝴蝶
41.木鱉子
42.毛訶子
43.火麻仁
44.牛膝
45.王不留行
46.車前子
47.絲瓜絡
48.冬瓜皮
49.北豆根
50.平貝母
51.玄參
52.石菖蒲
53.瓜蔞
54.甘草
55.白及
56.白頭翁
57.白芍
58.白芷
59.白屈菜
60.白果
61.白扁豆
62.白蘞
63.白薇
64.石斛
65.艾葉
66.龍眼肉
67.龍刪葉
68.亞乎奴（錫生藤）
69.決明子
70.地膚子
71.地黃
72.地榆
73.地錦草
74.當歸
75.朱砂根
196.土鱉蟲
197.全蝎
198.雞內金
199.龜甲
200.金錢白花蛇
201.海馬
202.海龍
203.海螵蛸
204.蛇蛻
205.鹿茸
206.蜈蚣
207.蟬蛻
208.鱉甲

參考文獻
附錄1 DNA提取方法及試劑配制
附錄2 DNA條形碼引物及PCR擴增程序
附錄3 DNA條形碼常用網址
附錄4 陳士林課題組發表的關于中藥條形碼分子鑒定論文目錄
物種拉丁名索引

?傳統的形態分類鑒定需要較高的分類學知識和能力，而具有這種能力的專家非常有限。?即使是分類學家，由于對同，一形態學特征的重要性程度認識不同，或者對形態學特征變化的幅度把握不同，對不同的物種和分類群的劃分可能有不同的認識，致使某些物種或類群的劃分產生混亂。?原植物或原動物的形態特征可能在一定幅度內有較大的變化（變異），可能還要參考組織結構特征以及分子生物學特征等其他方法鑒定物種。
原植物或原動物鑒定是基原鑒定的一種方法，所不同的是前者必須依據對原植物和原動物全體的觀察才能確定物種，而基原鑒定可以直接對中藥材和飲片用其他方法（包括性狀、顯微和理化方法）確定物種，但原植物（原動物）鑒定是基原鑒定方法中最根本、最基礎的方法。
（二）性狀鑒定
性狀鑒定是依據對藥材和飲片性狀特征的描述進行鑒定的方法。性狀特征通過眼觀、手摸、鼻聞、口嘗、水試、火試等方法直接觀察得到，它們包括形狀、大小、色澤、表面、質地、斷面、氣味、味道以及水試和火試法中的現象。一方面，由于性狀特征是原植物（原動物）形態特征的一個廣義的延伸，如來自于植物的根、莖、皮、葉、花、果實、種子等中藥材或飲片，多少保留了部分原植物的形態和結構等信息，因此性狀特征一致的藥材出現假藥的概率相對小一些。其中有一部分中藥材和中藥飲片的性狀特征突出，它們保留了原植物（原動物）明確的物種信息，例如雞血藤、大血藤、杜仲、天麻、何首烏、桔梗、紅花、西紅花、蛤蚧等，單純憑一片飲片或藥材的性狀特征就能鑒定到物種；另外有很多藥材能通過性狀鑒定到某一個類群，例如黃精類、沙參類、大黃類等。另一方面，由于中藥材及其飲片大部分只是藥用植物或動物的一部分，而且經過凈制、切制、干燥、加工和炮制等，在此過程中失去很多代表來源物種的信息，增加了其物種鑒定的難度，因此大部分中藥單憑性狀很難準確確定品種，還需要輔助顯微鑒定和理化鑒定等其他方法，以保證鑒定結果的準確性。性狀鑒定是最經典的中藥鑒定方法，也是中藥鑒定的特色技術，其優點是快速、簡便、無損，但需要鑒定者具有一定理論基礎和豐富實踐經驗，推廣難度較大。
（三）顯微鑒定
顯微鑒定是通過顯微鏡對藥材的組織結構或粉末的顯微特征進行觀察，對中藥真偽以及品種進行鑒定的方法。有很多藥材，在性狀鑒別的基礎上通過顯微鑒別可以直接確定中藥的來源物種。文獻報道中有很多來源于近緣種藥用植物藥材的顯微鑒別方法。在孢粉學中，顯微鑒別包括超微結構分析，把通過應用花粉粒的顯微（超微）特征鑒別物種的能力發揮到了極致。顯微鑒別用于區別外形相似但不同類型的藥材或其混淆品時非常有效，但當區別來源于近緣動植物的藥材或飲片時，由于其基本結構大部分非常相似，可能只在細微結構或要素的分布及數量上有所差別，而且這些近緣種彼此間究竟能否區別開，沒有一個共性的方法，只有一個一個去觀察和比較。盡管如此，顯微鑒定方法的引入對中藥材和中藥飲片的鑒定具有很大的推動作用，它大大擴展了用性狀鑒定方法鑒別藥材真偽的準確性和客觀性，同時在失去藥材完整性狀信息的破碎藥材，或中成藥中以原粉入藥的中藥鑒定作出了重要貢獻。
（四）理化鑒定
理化鑒定是用物理和化學的方法對中藥的品種和質量進行的鑒定，由于該方法能準確測定中藥中的有效成分的含量，所以更注重用這一類方法來客觀評價中藥的內在質量；另一方面，理化方法目前也是鑒定中藥真偽最常用的客觀性鑒定方法，其中最實用的理化鑒定方法是色譜法和光譜法。
色譜法是指利用薄層色譜、氣相色譜、高效液相色譜、毛細管電泳色譜法、蛋白質電泳色譜等色譜技術及其指紋圖譜鑒定中藥的方法。薄層色譜和高效液相色譜在植物來源中藥的鑒定中應用最為普遍，蛋白質電泳則適用于動物來源和植物來源的種子類中藥品種的鑒定。色譜法的優點是可以得到較多的化學成分信息，彌補了性狀、顯微鑒定的不足。色譜法的主要缺點是專屬性不強，尤其當很多近緣中藥的化學成分類似時，其分辨率不高。但色譜法及其指紋色譜技術獨到的既有定性又有定量的特性，極大滿足了人們對藥材真實性和質量的雙重鑒定要求。
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