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《有機化學（第二版）》共17章，按照以官能團分章的方式編排，每章最后都設置了相應的習題。教材內容精練，重點突出。在選材和舉例方面，注重實用性和前沿性，許多實例都來自于科研。在內容設置上，在教授基礎知識的同時，注重培養學生的思考和探究能力，幾乎每個章節都設立了思考、引導和探究項目，可供學生討論。還設置了拓展閱讀部分，以拓展學生的知識面。《有機化學（第二版）》的另一特色是，引入理論計算，對每種官能團的代表化合物都擬合出形象的電子分布密度圖，便于讀者形象地理解化合物結構與反應性的關系。此外，為適應雙語教學需要，《有機化學（第二版）》對常用的有機化學名詞和重要概念標注了英文，涉及到的英文人名均直接使用英文姓名
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