合成基因組學（簡體書）

全書共9章，包括DNA與生命、DNA的結構、DNA化學合成技術、DNA酶法合成技術、DNA胞外拼裝方法、胞內組裝與轉移、DNA測序技術、基因編輯技術和人工合成基因組。重點介紹了合成基因組學的理論和技術，包括基因的設計、合成、編輯及修飾技術，儀器設備及應用等相關技術。

第1章 DNA與生命
第2章 DNA的結構
一、DNA的組成
（一）堿基
（二）戊糖
（三）脫氧核苷
（四）脫氧核苷酸
二、DNA的結構
（一）DNA的一級結構
（二）DNA的二級結構
（三）DNA的三級結構
三、DNA的理化性質
（一）DNA的酸鹼性質
（二）DNA的溶解性與黏度
（三）DNA的紫外吸收
（四）DNA的變性、複性
四、DNA的生物合成
（一）DNA的複製方式
（二）DNA複製所需要的酶及蛋白
（三）DNA的複製過程
第3章 DNA化學合成技術
一、DNA化學合成的發展歷程
二、DNA柱法合成
（一）合成
（二）切割和脫保護
（三）後處理
（四）存在的問題
三、寡核苷酸微陣列原位合成
（一）光刻法
（二）電化學陣列技術
（三）噴墨法
（四）DNA微陣列芯片
四、DNA微流控合成法
（一）微流控合成器
（二）微閥陣列
（三）毛細管內合成法
五、μParaflo技術
第4章 DNA酶法合成技術
一、無模板DNA合成
二、末端轉移酶
（一）酶的結構
（二）生理功能和應用
（三）催化性質
三、合成策略選擇
（一）研究重點
（二）阻斷3′-OH成鍵位點
（三）空間位阻效應
四、優勢和挑戰
第5章 DNA胞外拼裝方法
一、基於連接酶的拼裝策略
二、基於限制性核酸內切酶的拼裝策略
（一）BioBrick拼裝法
（二）iBrick拼裝法
（三）C-Brick拼裝法
（四）Golden Gate拼裝法
三、基於末端互補序列的聚合酶拼裝策略
（一）聚合酶逐級拼裝法
（二）重疊延伸PCR
（三）環形聚合酶延伸法
（四）SLiC拼裝法
四、Gibson拼裝法
五、DNA拼裝中糾錯
六、DNA拼裝後糾錯
（一）錯配結合蛋白MutS
（二）錯配切割酶
（三）定點誘變技術
第6章 胞內組裝與轉移
一、大腸桿菌的胞內組裝
（一）RecA重組系統
（二）Red/ET重組系統
二、釀酒酵母的胞內組裝
（一）酵母轉化耦聯重組技術
（二）DNA Assembler
（三）CasHRA技術
（四）SwAP-In技術
（五）染色體減數分裂交叉互換分級組裝
三、合成染色體的轉移
（一）陽離子脂質體法
（二）顯微注射法
（三）電轉化法
（四）PEG介導的細胞融合法
第7章 DNA測序技術
一、DNA測序技術的建立
二、第一代DNA測序技術
（一）Sanger/鏈終止測序法
（二）化學降解法
（三）熒光自動檢測技術
三、第二代DNA測序技術
（一）454焦磷酸測序技術
（二）Solexa測序技術
（三）SOLiD測序技術
（四）華大智造DNB-seq測序技術
四、第三代DNA測序技術
（一）tSMS測序技術
（二）SMRT測序技術
（三）納米孔測序技術
第8章 基因編輯技術
一、鋅指核酸酶技術
（一）ZFN技術的誕生
（二）ZFN的結構
（三）ZFN基因編輯機制
（四）ZFN的設計策略
（五）ZFN技術的缺點
二、轉錄激活因子效應物技術
（一）TALEN技術的誕生
（二）TALE結構域
（三）TALEN作用機制
（四）TALEN的設計策略
（五）TALEN的優勢與局限
三、CRISPR/Cas系統
（一）CRISPR/Cas技術的誕生
（二）CRISPR/Cas系統結構
（三）CRISPR/Cas系統工作原理
第9章 人工合成基因組
一、人工合成病毒基因組
（一）人工合成脊髓灰質炎病毒
（二）人工合成φX174噬菌體基因組
二、人工合成原核生物基因組
（一）人工合成生殖支原體基因組
（二）人工合成蕈狀支原體基因組控制的細胞
（三）人工合成最小基因組
（四）人工重編碼大腸桿菌基因組
（五）人工合成大腸桿菌基因組
三、人工合成酵母基因組
（一）釀酒酵母基因組結構特點
（二）人工合成酵母基因組計劃的產生及意義
（三）人工合成酵母基因組設計原則
（四）Sc2.0目前取得的成果