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商品簡介
目次
商品簡介
本書較為系統全面的介紹了生物信息學分析各個方面的軟件用法，結合具體實例，使大家應用起來更具用參照性。全書共分8章，內容包括（1）Unix/Linux操作系統介紹，介紹了基本的Unix/Linux操作命令（2）數據的基本處理,介紹了如何處理常用的生物信息學數據（3）序列的比對，介紹了常用的比對軟件的用法及其在應用過程中要注意的問題（4）基因組/基因的注釋，介紹了Coding和Non-Codoing基因的預測方法（5）SNP分析，介紹了常用的從生物學數據中尋找SNP的軟件（6）進化分析專題，介紹了幾個常用的用於分子進化分析的軟件，內容涉及進化樹的構建，Ka/Ks的計算等（7）基因表達分析專題，介紹了EST及生物芯片分析的流程和方法（8）蛋白質結構預測，介紹了蛋白質三維結構預測的流程及方法。
目次
序
前言
第1章 Unix/Linux操作系統介紹
1.1 遠程登錄
1.2 文件的復制、刪除和移動命令
1.3 目錄的創建、刪除及更改目錄命令
1.4 文本查看命令
1.5 文本處理命令
1.6 改變文件或目錄的權限命令
1.7 備份與壓縮命令
1.8 磁盤及系統管理
1.9 軟件安裝簡介
1.10 其他
第2章 數據的基本處理
2.1 數據常用格式介紹
2.2 測序原理介紹
2.3 華圖轉化（Phred）
2.4 文件轉換（phd2fasta）
2.5 載體屏蔽（cross_match）
2.6 序列聚類拼接
2.7 Consed
2.8 引物設計（Primer3）
主要參考文獻
第3章 序列的比對
3.1 全局比對
3.2 局部比對
主要參考文獻
第4章 基因組/基因的注釋
4.1 重復序列分析
4.2 RNA分析
4.3 基因預測
4.4 基因功能注釋
主要參考文獻
第5章 SNP分析
5.1 Polyphred
5.2 SNPdetector
5.3 cross_match
主要參考文獻
第6章 進化分析專題
6.1 Phylip
6.2 Paml
6.3 KaKs_Calculator
6.4 FGF
6.5 MEGA
主要參考文獻
第7章 基因表達分析專題
7.1 EST表達序列標簽分析
7.2 生物芯片分析
7.3 Motif預測
主要參考文獻
第8章 蛋白質結構預測
8.1 蛋白質結構知識介紹
8.2 蛋白質結構預測方法
8.3 蛋白質結構預測的Threading方法
8.4 蛋白質三維結構預測流程介紹
主要參考文獻
前言
第1章 Unix/Linux操作系統介紹
1.1 遠程登錄
1.2 文件的復制、刪除和移動命令
1.3 目錄的創建、刪除及更改目錄命令
1.4 文本查看命令
1.5 文本處理命令
1.6 改變文件或目錄的權限命令
1.7 備份與壓縮命令
1.8 磁盤及系統管理
1.9 軟件安裝簡介
1.10 其他
第2章 數據的基本處理
2.1 數據常用格式介紹
2.2 測序原理介紹
2.3 華圖轉化（Phred）
2.4 文件轉換（phd2fasta）
2.5 載體屏蔽（cross_match）
2.6 序列聚類拼接
2.7 Consed
2.8 引物設計（Primer3）
主要參考文獻
第3章 序列的比對
3.1 全局比對
3.2 局部比對
主要參考文獻
第4章 基因組/基因的注釋
4.1 重復序列分析
4.2 RNA分析
4.3 基因預測
4.4 基因功能注釋
主要參考文獻
第5章 SNP分析
5.1 Polyphred
5.2 SNPdetector
5.3 cross_match
主要參考文獻
第6章 進化分析專題
6.1 Phylip
6.2 Paml
6.3 KaKs_Calculator
6.4 FGF
6.5 MEGA
主要參考文獻
第7章 基因表達分析專題
7.1 EST表達序列標簽分析
7.2 生物芯片分析
7.3 Motif預測
主要參考文獻
第8章 蛋白質結構預測
8.1 蛋白質結構知識介紹
8.2 蛋白質結構預測方法
8.3 蛋白質結構預測的Threading方法
8.4 蛋白質三維結構預測流程介紹
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